כשהעיר נינג'גו נמצאת בסכנה מפני כוחות האופל, מתאחדים שישה בני נוער להגן עליה מפני לורד גרמדון וצבאותיו. בני הנוער, מתברר, שולטים בהחבא במיומנויות הלחימה העתיקות של הנינג'ות ובעזרתן מצילים את העיר מתבוסה. הפרק השלישי (ובואו לא נהמר שגם האחרון) בסדרת סרטי לגו מצליח לשלב את המוצר וההרפתקאה לחוויה אחת: מהנה עלילתית וקולנועית, מצליחה להיות מצחיקה ומתגמלת, ובאותה נשימה תריץ בוודאי צופים צעירים רבים בחיפוש אחר אבני המשחק החדשות. כך או כך, "לגו נינג'גו" מציע חווית אנימציה הוליוודית מובהקת, עם ערכי הפקה גבוהים ושילוב יעיל של חיוכים והתרגשות.